Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms