Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRWD3Q6RI45 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRWD3Q6RI45 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms