Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6P435 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6P435 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6P435 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6P435 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6P435 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6P435 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6P435 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6P435 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6P435 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6P435 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms