Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHEQ5VZ18 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms