Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms