Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSCN1Q16658 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSCN1Q16658 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms