Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF239Q16600 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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