Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms