Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM1Q15032 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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