Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNB1P98172 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms