Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms