Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLTPP55058 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLTPP55058 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLTPP55058 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLTPP55058 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLTPP55058 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms