Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TGM4P49221 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM4P49221 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM4P49221 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM4P49221 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM4P49221 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM4P49221 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TGM4P49221 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TGM4P49221 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TGM4P49221 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TGM4P49221 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms