Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SFTPDP35247 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms