Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSMA5P28066 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PSMA5P28066 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms