Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF4P23510 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms