Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TSPAN8P19075 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSPAN8P19075 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms