Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEFHP12036 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEFHP12036 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms