Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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