Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYF2O95926 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SYF2O95926 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SYF2O95926 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms