Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIN3BO60391 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms