Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CEP290O15078 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CEP290O15078 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CEP290O15078 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CEP290O15078 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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CEP290O15078 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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CEP290O15078 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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CEP290O15078 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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CEP290O15078 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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CEP290O15078 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CEP290O15078 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CEP290O15078 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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