Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E9PBE3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E9PBE3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E9PBE3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E9PBE3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms