Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMGB1P1B2RPK0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms