Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSDA5PKW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms