Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMX2A2RU54 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMX2A2RU54 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms