Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FBXO4Q9UKT5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms