Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF7Q9UBF6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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