Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NKIRAS1Q9NYS0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms