Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RRP7BPQ9NSQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RRP7BPQ9NSQ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms