Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC31BQ9NQW1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms