Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGIP1Q9BQI5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms