Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAT1Q99536 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAT1Q99536 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms