Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VCPIP1Q96JH7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms