Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZBED3Q96IU2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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