Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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H2-M10.5Q85ZW7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2-M10.5Q85ZW7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M10.5Q85ZW7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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