Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C10orf55Q5SWW7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C10orf55Q5SWW7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C10orf55Q5SWW7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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