Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BFSP2Q13515 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BFSP2Q13515 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms