Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC18A2Q05940 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms