Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERFP50548 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERFP50548 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERFP50548 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms