Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD8P48556 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD8P48556 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms