Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTRNP46939 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTRNP46939 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTRNP46939 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTRNP46939 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UTRNP46939 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTRNP46939 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms