Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GLI2P10070 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GLI2P10070 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GLI2P10070 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GLI2P10070 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GLI2P10070 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms