Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM10L2BP0DMW5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms