Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RGPD1P0DJD0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RGPD1P0DJD0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms