Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMGB1P1B2RPK0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms