Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC22A11Q9NSA0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A11Q9NSA0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms