Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP2-4Q9BYR9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms