Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC106Q9BWC9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC106Q9BWC9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms