Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FGD4Q96M96 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms